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Les tutelles MNHN - CNRS - Inserm
Le laboratoire Structure et Instabilité des génomes UMR 7196 / U1154 est une unité mixte de recherche sous la co-tutelle du Muséum national d'Histoire naturelle, du Centre national de la Recherche Scientifique (CNRS), et de l’Institut national de la santé et de la recherche médicale (Inserm).
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UMR 7196 - U1154 - Structure et Instabilité des Génomes
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Cournac Axel, Marbouty Martial, Mozziconacci Julien & Koszul Romain, 2016 — Generation and Analysis of Chromosomal Contact Maps of Yeast Species.. Methods in Molecular Biology vol. 1361, , dir. {Humana Press/Springer Imprint} p. 227-45
https://dx.doi.org/10.1007/978-1-4939-3079-1_13
Hubstenberger Arnaud, Courel Maïté, Bénard Marianne, Souquère Sylvie, Ernoult-Lange Michèle M., Chouaib Racha, Yi Zhou, Morlot Jean-Baptiste, Munier Annie, Fradet Magali, Daunesse Maëlle, Bertrand Edouard, Pierron Gérard, Mozziconacci Julien, Kress Michel et al., octobre 2017 — P-Body Purification Reveals the Condensation of Repressed mRNA Regulons. Molecular Cell vol. 68, n° 1, dir. {Elsevier} 144-157.e5
https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2017.09.003
Lazar-Stefanita Luciana, Scolari Vittore F, Mercy Guillaume, Muller Héloïse, Guérin Thomas M M, Thierry Agnès, Mozziconacci Julien & Koszul Romain, septembre 2017 — Cohesins and condensins orchestrate the 4D dynamics of yeast chromosomes during the cell cycle. EMBO Journal vol. 36, n° 18, dir. {EMBO Press} p. 2684-2697
https://dx.doi.org/10.15252/embj.201797342
Mozziconacci Julien & Koszul Romain, août 2015 — Filling the gap: Micro-C accesses the nucleosomal fiber at 100-1000 bp resolution.. Genome Biology vol. 16, n° 1, dir. {BioMed Central} p. 169
https://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0744-8
Barbi Maria, Mozziconacci Julien & Victor Jean-Marc, 2005 — How does the chromatin fiber deal with topological constraints?. Physical Review E : Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics vol. 71, , dir. {American Physical Society} p. 031910 Presented in Nature ’’News and views in brief’’ Vol. 429 (13 May 2004). Movies available at http://www.lptl.jussieu.fr/recherche/operationE_fichiers/Page_figurePRL.html
https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.71.031910
Lesne Annick & Mozziconacci Julien, avril 2019 — « Formes mathématiques, formes physiques, formes vivantes » in Le Rêve de Formes. Arts, Sciences ... et Cie,.. , , dir. {Le Seuil}
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02308929
Morlot Jean-Baptiste, Mozziconacci Julien & Lesne Annick, décembre 2016 — Network concepts for analyzing 3D genome structure from chromosomal contact maps. EPJ Nonlinear Biomedical Physics vol. 4, n° 1, dir. {EDP Sciences}
https://dx.doi.org/10.1140/epjnbp/s40366-016-0029-5
Merle Mélody, Messio Laura & Mozziconacci Julien, octobre 2019 — Turing-like patterns in an asymmetric dynamic Ising model. Physical Review E vol. 100, n° 4, dir. {American Physical Society (APS)}
https://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.100.042111
Bancaud Aurélien, Conde E Silva Natalia, Barbi Maria, Wagner Gaudeline, Allemand Jean-François, Mozziconacci Julien, Lavelle Christophe, Croquette Vincent, Victor Jean-Marc, Prunell Ariel & Viovy Jean-Louis, 2006 — Structural plasticity of single chromatin fibers revealed by torsional manipulation.. Nature Structural and Molecular Biology vol. 13, , dir. {Nature Publishing Group} p. 444-450
https://dx.doi.org/10.1038/nsmb1087
Cournac Axel, Koszul Romain & Mozziconacci Julien, janvier 2016 — The 3D folding of metazoan genomes correlates with the association of similar repetitive elements. Nucleic Acids Research vol. 44, n° 1, dir. {Oxford University Press} p. 245-255
https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkv1292
Marbouty Martial, Cournac Axel, Flot Jean-François, Marie-Nelly Hervé, Mozziconacci Julien & Koszul Romain, décembre 2014 — Metagenomic chromosome conformation capture (meta3C) unveils the diversity of chromosome organization in microorganisms. eLife vol. 3, , dir. {eLife Sciences Publication} e03318
https://dx.doi.org/10.7554/eLife.03318
Marbouty Martial, Le Gall Antoine, Cattoni Diego I, Cournac Axel, Koh Alan, Fiche Jean-Bernard, Mozziconacci Julien, Murray Heath, Koszul Romain, Nollmann Marcelo & Le Gall Antoine, août 2015 — Condensin- and Replication-Mediated Bacterial Chromosome Folding and Origin Condensation Revealed by Hi-C and Super-resolution Imaging.. Molecular Cell vol. 59, n° 4, dir. {Elsevier} p. 588-602
https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2015.07.020
Haschka Thomas, Baptiste Morlot Jean, Carron Leopold & Mozziconacci Julien, juillet 2021 — Improving distance measures between genomic tracks with mutual proximity. Briefings in Bioinformatics , , dir. {Oxford University Press (OUP)}
https://dx.doi.org/10.1093/bib/bbab266
Decombe Sheldon, Loll François, Caccianini Laura, Affannoukoué Kévin, Izeddin Ignacio, Mozziconacci Julien, Escudé Christophe & Lopes Judith, juillet 2021 — Epigenetic rewriting at centromeric DNA repeats leads to increased chromatin accessibility and chromosomal instability. Epigenetics & Chromatin vol. 14, n° 1, dir. {BioMed Central}
https://dx.doi.org/10.1186/s13072-021-00410-x
Haschka Thomas, Ponger Loic, Escude Christophe & Mozziconacci Julien, juin 2021 — MNHN-Tree-Tools: A toolbox for tree inference using multi-scale clustering of a set of sequences. Bioinformatics , , dir. {Oxford University Press (OUP)}
https://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab430
Baudement Marie, Cournac Axel, Court Franck, Seveno Marie, Parrinello Hugues, Reynes Christelle, Sabatier Robert, Bouschet Tristan, Yi Zhou, Sallis Sephora, Tancelin Mathilde, Rebouissou Cosette, Cathala Guy, Lesne Annick, Mozziconacci Julien et al., novembre 2018 — High-salt Recovered Sequences are associated with the active chromosomal compartment and with large ribonucleoprotein complexes including nuclear bodies. Genome Research vol. 28, n° 11, dir. {Cold Spring Harbor Laboratory Press} p. 1733-1746
https://dx.doi.org/10.1101/gr.237073.118
Guidi Micol, Ruault Myriam, Marbouty Martial, Loïodice Isabelle, Cournac Axel, Billaudeau Cyrille, Hocher Antoine, Mozziconacci Julien, Koszul Romain & Taddei Angela, septembre 2015 — Spatial reorganization of telomeres in long-lived quiescent cells. Genome Biology vol. 16, n° 1, dir. {BioMed Central} p. 206
https://dx.doi.org/10.1186/s13059-015-0766-2
Cournac Axel, Marie-Nelly Hervé, Marbouty Martial, Koszul Romain & Mozziconacci Julien, 2012 — Normalization of a chromosomal contact map. BMC Genomics vol. 13, n° 1, dir. {BioMed Central} p. 436
https://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-13-436
Lesne Annick, Riposo Julien, Roger Paul, Cournac Axel & Mozziconacci Julien, 2014 — 3D genome reconstruction from chromosomal contacts. Nature Methods vol. 11, , dir. {Nature Publishing Group} p. 1141-1143
https://dx.doi.org/10.1038/NMETH.3104
Khodabandelou Ghazaleh, Routhier Etienne & Mozziconacci Julien, juin 2020 — Distributed under Creative Commons CC-BY 4.0 Genome annotation across species using deep convolutional neural networks. PeerJ Computer Science vol. 6, , dir. {PeerJ} e278
https://dx.doi.org/10.7717/peerj-cs.278
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  • Alice BRION
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  • Evelyne DUVERNOIS
  • Christophe ESCUDÉ
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Entité de rattachement

  • (-) Équipe ARChE
  • Équipe GE2R
  • Équipe GPA
  • Équipe SANTÉ

Organisme de rattachement

  • CNRS
  • INSERM
  • (-) MNHN

Statut

  • Doctorant
  • Ingénieur de Recherche
  • Ingénieur d’Étude
  • Maître de Conférences
  • Professor
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