TACGENE

Crédits

@tacgene

Personnes Impliquées

Contact: tacgene[at]mnhn.fr

Présentation

TACGENE a été créée en 2011 au sein de l’U1154–UMR7196, pour faciliter l’accès des laboratoires académiques aux techniques d’édition du génome et bénéficie d’un label IBiSA  depuis 2016.

Soutenu dans le cadre du programme Investissement d’Avenir - Infrastructures Nationales en Biologie Santé, nous avons développé une solide expertise dans le design, la production et l’utilisation des technologies TALEN (Transcription-Activated like Effector Nucleases), puis CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)/Cas9. Nous les utilisons dans des cellules en culture dans nos projets de recherche et en collaboration, dans de nombreux organismes modèles, en particulier le rat, la souris et le poisson-zèbre au travers du réseau Celphedia.

Les activités de recherche et de développement que nous menons dans l’équipe GE2R  pour améliorer ces technologies, en parallèle aux activités de service de TACGENE, nous permettent de proposer aujourd’hui des solutions et une expertise avancée sur les différentes problématiques d’édition du génome (Knock-out, Knock-In…).

Stratégies d’édition du génome proposées par TACGENE

Crédits

©C.Giovannangeli

Expertises et services proposés

• Design d’une stratégie d’édition du génome en fonction du projet
• Design et sélection des sgRNAs et des pegRNAs
• Conseils d’utilisation et aide au génotypage
• Mise à disposition de protocoles sur demande
• Production de Cas9 et variants (ARNm et protéines recombinantes)
• Transcription des sgRNAs/pegRNAs et contrôle qualité
• Production d’ADN donneurs
• Tests d’activité in vitro des complexes sgARN/Cas9 purifiés
• Transfections et tests d’activité en cellules
• Clonage cellulaire de lignées éditées

Principales Collaborations

• Ignacio Anegon,TRIP/Inserm, Nantes (Edition du génome chez le Rat)
• Filippo Del Bene, Institut de la Vision/Inserm, Paris (Edition du génome chez le Zebrafish)
• Pierre Affaticati, TEFOR CoreFacility/CNRS, Gif-sur-Yvette (Edition du génome chez le Zebrafish)
• Geneviève Tavernier, Anexplo/Inserm-CNRS, Toulouse (Edition du génome chez la Souris)
• Suzy Markossian, IGFL-ENS Lyon (Edition du génome chez la Souris)

Exemples de Publications récentes issues des activités de TACGENE

Gaillard AL, Mohamad T, Quan FB, de Cian A, Mosimann C, Tostivint H, Pézeron G. Urp1 and Urp2 act redundantly to maintain spine shape in zebrafish larvae. Dev Biol. 2023 Apr;496:36-51. doi: 10.1016/j.ydbio.2023.01.010.

Mangeol P, Massey-Harroche D, Richard F, Concordet JP, Lenne PF, Le Bivic A. Super-resolution imaging uncovers the nanoscopic segregation of polarity proteins in epithelia. Elife. 2022 Nov 7;11:e62087. doi: 10.7554/eLife.62087.

Dos Santos M, Backer S, Auradé F, Wong MM, Wurmser M, Pierre R, Langa F, Do Cruzeiro M, Schmitt A, Concordet JP, Sotiropoulos A, Jeffrey Dilworth F, Noordermeer D, Relaix F, Sakakibara I, Maire P. A fast Myosin super enhancer dictates muscle fiber phenotype through competitive interactions with Myosin genes. Nat Commun. 2022 Feb 24;13(1):1039. doi: 10.1038/s41467-022-28666-1. PMID: 35210422; PMCID: PMC8873246.

Recazens E, Tavernier G, Dufau J, Bergoglio C, Benhamed F, Cassant-Sourdy S, Marques MA, Caspar-Bauguil S, Brion A, Monbrun L, Dentin R, Ferrier C, Leroux M, Denechaud PD, Moro C, Concordet JP, Postic C, Mouisel E, Langin D. ChREBPβ is dispensable for the control of glucose homeostasis and energy balance. JCI Insight. 2022 Feb 22;7(4):e153431. doi: 10.1172/jci.insight.153431.

Mérien A, Tahraoui-Bories J, Cailleret M, Dupont JB, Leteur C, Polentes J, Carteron A, Polvèche H, Concordet JP, Pinset C, Jarrige M, Furling D, Martinat C. CRISPR gene editing in pluripotent stem cells reveals the function of MBNL proteins during human in vitro myogenesis. Hum Mol Genet. 2021 Dec 17;31(1):41-56. doi: 10.1093/hmg/ddab218.

Joubert R, Mariot V, Charpentier M, Concordet JP, Dumonceaux J. Gene Editing Targeting the DUX4 Polyadenylation Signal: A Therapy for FSHD? J Pers Med. 2020 Dec 23;11(1):7. doi: 10.3390/jpm11010007. PMID: 33374516; PMCID: PMC7822190.

Pavani G, Laurent M, Fabiano A, Cantelli E, Sakkal A, Corre G, Lenting PJ, Concordet JP, Toueille M, Miccio A, Amendola M. Ex vivo editing of human hematopoietic stem cells for erythroid expression of therapeutic proteins. Nat Commun. 2020 Jul 29;11(1):3778. doi: 10.1038/s41467-020-17552-3. Erratum in: Nat Commun. 2020 Aug 13;11(1):4146. PMID: 32728076; PMCID: PMC7391635.

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